2025年2月19日，清华大学生命学院、清华-IDG/麦戈文脑科学研究院贾晓轩课题组在Nature communications上发表了题为Deciphering neuronal variability across states reveals dynamic sensory encoding的研究论文。该研究以不同大脑状态为时间轴，通过建模分析的方法，从小鼠视觉系统的神经活动中分离出大脑内活动，脑电波和自发行为等因素对神经活动和视觉刺激编码的影响随大脑状态变化的动态特征。揭示了视觉编码模型对神经活动预测能力的动态上限及其影响因素。

2024年12月23日，清华大学药学院、清华-IDG/麦戈文脑科学研究院肖百龙课题组，清华大学生命学院李雪明课题组与清华大学药学院田博学课题组合作，在神经科学领域权威期刊《神经元》（Neuron）杂志在线发表了题为《中间开放态结构揭示机械激活PIEZO1 通道的门控转换》（An intermediate open structure reveals the gating transition of the mechanicallyactivated PIEZO1 channel）的研究长文，解析了机械力受体PIEZO1的中间开放状态的结构，揭示了其精细结构动态变化和门控转换过程，并结合结构分析、分子动力学模拟和电生理实验，定义了其关闭态、开放态和失活态的不同构象状态，提出了其门控循环机制，完善了其曲率感知理论学说。

2024年12月16日，清华大学生命科学学院、清华-IDG/麦戈文脑科学研究院钟毅课题组与北京智源人工智能研究院雷博团队在Neuron上在线发表了题为“Reconstructing a new hippocampal engram for systems reconsolidation and remote memory updating”的研究论文。该研究揭示了远期记忆系统性再固化的记忆印迹机制，证明了海马体招募新的记忆印迹细胞重建新记忆印迹是该过程的核心机制。

2024年11月15日，清华大学生命科学学院、清华-IDG/麦戈文脑科学研究院张伟课题组在 Nature Communications期刊上发表了题为“Mating reconciles fitness and fecundity by switching diet preference in flies”的研究论文（DOI: 10.1038/s41467-024-54369-w）。该研究揭示了黑腹果蝇通过调整蛋白质摄入偏好来平衡生殖行为与生存能力的机制，并阐明了这一现象背后的雌雄二态性神经调控网络。

2024年10月15日，清华大学生命科学学院、清华-IDG麦戈文脑科学研究院钟毅课题组在Cell Reports上发表了题为“Identification of GABAergic Subpopulations in the Lateral Hypothalamus for Home-Driven Behaviors in Mice”的研究论文，揭示了大脑如何处理家相关的信息并触发相关的情绪行为反应。

清华大学生物医学工程学院刘鹏团队联合清华大学临床医学院、清华-IDG/麦戈文脑科学研究院章薇团队在hLife上发表题为“HiTIP-seq profiles epigenomic reprogramming of patient-derived diffuse midline glioma stem cells to epigenetic therapy”的封面文章。

2024年9月25日，清华大学自动化系、清华-IDG/麦戈文脑科学研究院于国强团队与合作者在Neuron期刊共同发表题为"Data Science and its future in large neuroscience collaborations"的文章，调研并总结了目前脑科学研究中数据科学实践与研究存在的问题，并据此提出切实有效的改进建议，从而使脑数据科学成为脑科学发展的促进而不是障碍因素。此建议期望减小不同脑科学团队在科学研究过程中数据管理与分析之间的巨大差异，消除合作过程中的障碍，充分发掘数据的价值，加强科学研究的可重复性。

2024年9月13日，清华-IDG/麦戈文脑科学研究院三个团队，分别来自清华大学自动化系戴琼海、清华大学基础医学院郭增才、清华大学自动化系吴嘉敏，作为共同通讯在Cell上发表题为Long-term mesoscale imaging of 3D intercellular dynamics across a mammalian organ的研究论文，研制了一台大视场高分辨率的三维介观尺度荧光显微镜（RUSH3D），视场达到8 mm×6 mm，系统分辨率高达3 μm×3 μm×6 μm，并且具备低光毒性的优点，可以以20Hz体成像的速率连续拍摄数小时。