2023年6月2日，清华大学精密仪器系、清华-IDG/麦戈文脑科学研究院孔令杰课题组与清华大学生命学院、北京大学生命学院合作者在Science Advances以长文的形式在线发表了题为“Plug-and-play fibre-optic sensors based on engineered cells for neurochemical monitoring at high specificity in freely moving animals”的研究论文。该研究通过设计一种基于工程细胞的即插即用型光纤探针(FOPECs)，实现了自由活动、非转基因动物体内神经化学物质的实时、高特异性检测。其优势是不受限于动物物种，可实现即时、高特异性检测；除可应用于神经系统，也可应用于血液循环系统，监测神经递质或调质的动态浓度。

2023年5月31日， 密歇根大学医学院齐岭教授课题组及清华大学生命科学院，清华-IDG/麦戈文脑科学研究院吝易教授课题组在 Nature Communications 杂志上在线发表题为 The mechanisms to dispose of misfolded proteins in the endoplasmic reticulum of adipocytes 的研究论文。研究揭示了在小鼠脂肪细胞中SEL1L-HRD1 ERAD和ER-phagy的共同作用机制，并发现脂肪细胞对错误折叠蛋白在内质网中的积累可能具有高度适应性。

2023年5月12日，清华大学戴琼海、吴嘉敏、祁海共同通讯在Cell上发表研究论文。该研究首次提出了基于空间约束的多角度衍射编码，实现非相干光孔径合成；建立了双光子合成孔径显微术（Two-photon synthetic aperture microscopy, 2pSAM），“化点为针”，通过多角度针状光束的扫描在实现高速三维感知的同时，将双光子成像光毒性降低了1000倍以上。

2023年5月4日，清华大学医学院教授、清华-IDG/麦戈文脑科学研究院研究员贾怡昌、中科院上海药物所高召兵和北京大学第三医院樊东升实验室于Cell Research在线发表文章， 首次证实了CLCC1是内质网定位的氯离子通道的孔道形成组分；从全长序列看，CLCC1与CLIC（Chloride intracellular channel）蛋白序列并无相似性，该研究团队建议根据CLCC1内质网定位特征和电生理数据，将该基因重新命名为ER Anion Channel 1 (ERAC1)；CLCC1调节内质网阴、阳离子稳态；CLCC1的功能缺失会破坏内质网的离子稳态，引发内质网胁迫并参与肌萎缩侧索硬化（Amyotrophic lateral sclerosis, ALS）的病理和致病。

2023年4月6日，Nature Methods在线发表了清华大学成像与智能技术实验室戴琼海院士团队题为“Virtual-scanning light-field microscopy for robust snapshot high-resolution volumetric imaging”的研究论文。该团队在扫描光场显微的基础上，发布了国际首个大规模多样本的显微光场超分辨率数据集，进一步提出了虚拟扫描光场显微技术（VsLFM）

2023年4月3日，孔令杰课题组与合作者在Nature Machine Intelligence杂志以长文的形式在线发表了题为“Deep learning supported discovery of biomarkers for clinical prognosis of liver cancer”的研究论文。该研究以AI和病理医生相互协作的方式构建了癌症预后标志物智能挖掘平台PathFinder，证实了仅使用活检病理样本的全局组织稀疏空间分布信息即可实现准确预后。并以肝细胞癌为例进行数据挖掘、表征，验证了两种全新的预后标志物，展示了深度学习方法在精准医学应用的新范式。

2023年3月28日，清华大学时松海团队在Cell Reports上发表了题为“Developmental neuronal origin regulates neocortical map formation”的文章，从谱系依赖的神经环路形成以及功能组装方面系统地解析了小鼠初级视觉皮层神经功能图谱形成的机理以及潜在的分子调控机制。

2023年3月21日，清华大学生命科学学院、清华-IDG/麦戈文脑科学研究院、清华-北大生命科学联合中心钟毅课题组在eLife期刊发表了题为“果蝇的两个连续学习任务间相互干扰机制的遗传解析”（Genetic dissection of mutual interference between two consecutive learning tasks in Drosophila）的文章，发现果蝇连续学习两个不同任务时，新旧任务之间的相互干扰由不同的分子机制进行调控。